Genominis istorinių ir šiuolaikinių Šiaurės Amerikos bizonų hibridizacijos įvertinimas (Bison bison)

  • Vangas, K. ir kt. Neužbaigtas giminės rūšiavimas, o ne hibridizacija, paaiškina nenuoseklią protingųjų filogeniją. Komun. Biol. 1169 (2018).

    Google Scholar straipsnis

  • Froese, D. ir kt. Fosilijos ir genominiai įrodymai riboja bizonų atvykimo į Šiaurės Ameriką laiką. Proc. Natl. akad. Sci. 1143457 LP – 3462 (2017).

    ADS straipsnis Google Scholar

  • Shaw, JH. Kiek stumbrų iš pradžių gyveno vakarų arealuose? Rangelands 17148–150 (1995).

    Google Scholar

  • Flores, D. Stumbrų ekologija ir bizonų diplomatija: Pietų lygumos nuo 1800 iki 1850 m. J. Am. Ist. 78465–485 (1991).

    Google Scholar straipsnis

  • Koucky, RW 1882 m. buivolo nelaimė. Šiaurės Dakotos istorija 5023–30 (1983).

    CAS Google Scholar

  • Roe, FG Šiaurės Amerikos buivolai: kritinis laukinės rūšies tyrimas. (University of Toronto Press, 1970).

  • Boydas, MM Trumpas aprašymas apie Amerikos bizonų kryžminimo su naminiais galvijais eksperimentą. J. Paveldimumas 4324–331 (1908).

    Google Scholar straipsnis

  • Boyd, MM Crossing Stumbras ir galvijai: pirmasis pavojingas kryžius, bet kiekvienos kitos kartos rezultatai yra geresni – tikimasi paimti bizonų kailį ir kuprą ir uždėti juos ant naminio jaučio nugaros. J. Heredas. 5189–197 (1914).

    Google Scholar straipsnis

  • Labanakt, C. Mano patirtis su bizonų hibridais. J. Heredas. 5197–199 (1914).

    Google Scholar straipsnis

  • Jonesas, CJ veisimas Cattelo. J. Paveldimumas 3161–165 (1907).

    Google Scholar straipsnis

  • Amerikos bizonų draugija. Amerikos bizonų draugijos metinė ataskaita 1905–1908 m. t. [1st]-2-oji (Bendruomenė, 1908).

  • Hornaday, WT Amerikos bizonų naikinimas. (Smithsonian Institution, Vašingtono vyriausybės spaustuvės, 1889).

  • Coder, GD Nacionalinis judėjimas siekiant išsaugoti Amerikos buivolus JAV ir Kanadoje 1880–1920 m. ProQuest disertacijos ir tezės (Ohajo valstijos universitetas, 1975).

  • Dary, D. Buivolo knyga: visa saga apie Amerikos gyvūną. 434 p. (1989).

  • Nykstančios laukinės gamtos statuso Kanadoje komitetas (COSEWIC). COSEWIC įvertinimas ir būklės ataskaita apie Plains Bison Bison bison bizonus ir Wood Bison Bison bison athabascae Kanadoje. (2013).

  • Goganas, PJ ir Dratchas, P. Stumbrų apsaugos iniciatyva: Stumbrų apsaugos genetikos seminaras: ataskaita ir rekomendacijos. Gamtos išteklių ataskaita http://pubs.er.usgs.gov/publication/70136147 (2010).

  • Keturiolika buivolių yra laisvi Katalinos saloje. Katalinos salos gyventoja 10 (1924).

  • Polziehn, RO, Strobeck, C., Sheraton, J. & Beech, R. Bovine mtDNR aptikta Šiaurės Amerikos bizonų populiacijose. Konservuoti. Biol. 91638–1643 (1995).

    Google Scholar straipsnis

  • Ward, TJ, Bielawski, JP, Davis, SK, Templeton, JW & Derr, JN Naminių galvijų hibridų identifikavimas laukinių galvijų ir bizonų rūšyse: bendras metodas naudojant mtDNR žymenis ir parametrinį įkrovos diržą. Anim. Konservuoti. 251–57 (1999).

    Google Scholar straipsnis

  • Douglasas, KC ir kt. Pilna stumbrų ir bizonų – galvijų hibridų mitochondrijų DNR sekos analizė: funkcija ir filogenezė. Mitochondrija 11166–175 (2011).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Halbert, ND & Derr, JN Išsamus galvijų introgresijos į JAV federalines bizonų bandas įvertinimas. J. Heredas. 981–12 (2007).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Halbert, ND, Ward, TJ, Schnabel, RD, Taylor, JF ir Derr, JN Apsaugos genomika: naminių galvijų chromosomų segmentų disbalanso kartografavimas Šiaurės Amerikos bizonų populiacijose. Mol. Ecol. 142343–2362 (2005).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Durand, EY, Patterson, N., Reich, D. & Slatkin, M. Senovės priemaišų tarp artimai susijusių populiacijų testavimas. Mol. Biol. Evol. 282239–2252 (2011).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Ward, BJ ir van Oosterhout, C. hybridcheck: programinė įranga, skirta greitam rekombinantinių regionų aptikimui, vizualizavimui ir datavimui genomo sekos duomenyse. Mol. Ecol. Išteklius. 16534–539 (2016).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Lo, C.-W. ir kt. BoLA-DRB3 polimorfizmas yra susijęs su skirtingu jautrumu galvijų leukemijos viruso sukeltai limfomai ir provirusinei apkrovai. Virusai. 12 (2020).

  • Patra, B. ir kt. Galvijų pagrindinio histokompatibilumo komplekso I klasės (BoLA-A) alelių susiejimas su veršelių imuniniu atsaku į Brucella abortus padermę 19. Veterinarinis mikrobiolas. 242108569 (2020).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Kalmas, P. Kelionės į Šiaurės Ameriką; kurioje yra jos gamtos istorija ir netiesioginis pasakojimas apie jos plantacijas ir žemės ūkį apskritai, su šalies civiline, bažnytine ir komercine valstybe, gyventojų manieromis ir keliais smalsuoliais.. (Išspausdinta T. Lowndesui, 1773).

  • Audubon, J. & Bachman, J. Šiaurės Amerikos keturkojai. 2. VG Audubon, Niujorkas, 446 p. (1851).

  • Cahill, JA ir kt. Genominiai įrodymai, kad per paskutinį ledynmetį baltieji lokiai plačiai susimaišė su rudaisiais lokiais. Mol. Biol. Evol. 351120–1129 (2018).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Árnason, Ú., Lammers, F., Kumar, V., Nilsson, MA ir Janke, A. Mėlynojo banginio ir kitų rūkalų viso genomo sekvenavimas randa introgresinio genų srauto parašus. Mokslo pažanga 4(2018).

  • Pilka, AP Žinduolių hibridai: kontrolinis sąrašas su bibliografija. Sandraugos gyvūnų veisimo ir genetikos biuras, Edinburgas. Tech. Komun. 101–262 (1971).

    Google Scholar

  • Trumpas, RV Įvadas į žinduolių tarprūšinius hibridus. J. Paveldimumas 88355–357 (1997).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Shurtliff, QR Žinduolių hibridinės zonos: apžvalga. Žinduolių kun. 431–21 (2013).

    Google Scholar straipsnis

  • Savriama, Y. ir kt. Žinduolių hibridizacijos fenogenotipinės ribos. Karališkoji soc. Atidarykite Sci. 5180903 (2021).

    Google Scholar straipsnis

  • McDonaldas, JN Šiaurės Amerikos bizonai: jų klasifikacija ir evoliucija. (Kalifornijos universiteto leidykla, 1981).

  • Wu, D.-D. ir kt. Visiška introgresija palengvino prijaukinimą ir prisitaikymą Bos rūšių komplekse. Nat. Ecol. Evolut. 21139–1145 (2018).

    Google Scholar straipsnis

  • Dobsonas, LK ir kt. Šiaurės Amerikos bizono (Bison bison) etaloninio genomo de novo surinkimas ir anotacija bei vėlesnis varianto identifikavimas. Anim. Genet. 52263–274 (2021).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Oppenheimeris, J. ir kt. Amerikos bizonų, bizonų bizonų etaloninis genomo rinkinys. J. Heredas. 112174–183 (2021).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Curry, CJ & Derr, JN Liūtų miniSTR kūrimas, skirtas naudoti su šiuolaikiniais ir istoriniais DNR mėginiais. Afr. J. Wildlife Res. 4964–74 (2019).

    Google Scholar

  • Curry, CJ, White, PA ir Derr, JN. Genetinė afrikinių liūtų (Panthera leo) Zambijoje analizė palaiko judėjimą per antropogenines ir geografines kliūtis. PLoS ONE 14e0217179 (2019).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Yang, T., Miller, M., Forgacs, D., Derr, JN ir Stothard, P. SNP pagrįstų genominių įrankių kūrimas Kanados bizonų pramonei: tėvystės patikrinimas ir porūšių sudėtis. Priekyje. Genet. 11585999 (2020).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Čiangas, C. ir kt. SpeedSeq: itin greita asmeninio genomo analizė ir interpretacija. Nat. Metodai 12966–968 (2015).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Li, H. ir kt. Sekos lygiavimo / žemėlapio formatas ir SAMtools. Bioinformatika 252078–2079 (2009).

    Google Scholar

  • van der Auwera, GA ir kt. Nuo „FastQ“ duomenų iki didelio patikimumo variantų iškvietimų: genomo analizės įrankių rinkinio geriausios praktikos rinkinys. Curr. Bioinformacijos protokolai. 4311.10.1-11.10.33 (2013).

    Google Scholar

  • Danečekas, P. ir kt. Variantų skambučio formatas ir VCFtools. Bioinformatika 272156–2158 (2011).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Purcell, S. ir kt. PLINK: įrankių rinkinys, skirtas viso genomo susiejimo ir populiacijos sąsajų analizei. Am. J. Žmogaus Genetas. 81559–575 (2007).

    CAS straipsnis Google Scholar

  • Chang, CC ir kt. Antrosios kartos PLINK: susiduriame su didesnių ir turtingesnių duomenų rinkinių iššūkiu. GigaScience 41–16 (2015).

    Google Scholar straipsnis

  • Raj, A., Stephens, M. ir Pritchard, JK fastSTRUCTURE: Variational Inference of population structure in large SNP data sets. Genetika 197573–589 (2014).

    Google Scholar straipsnis

  • Rosenberg, NA DISTRUCT: Programa, skirta grafiniam gyventojų struktūros atvaizdavimui. Mol. Ecol. Pastabos 4137–138 (2004).

    Google Scholar straipsnis

  • Pickrell, J. & Pritchard, J. Išvados apie populiacijos skilimus ir mišinius iš viso genomo alelių dažnio duomenų. Nat. Prec. https://doi.org/10.1038/npre.2012.6956.1 (2012).

    Google Scholar straipsnis

  • Soraggi, S., Wiuf, C. & Albrechtsen, A. daro galingą išvadą iš mažos aprėpties viso genomo duomenų D statistikos. G3 genai | genomai | genetika 8551–566 (2018).

  • Korneliussen, TS, Albrechtsen, A. & Nielsen, R. ANGSD: Naujos kartos sekos duomenų analizė. BMC Bioinform. 15356 (2014).

    Google Scholar straipsnis

  • Parašykite komentarą

    El. pašto adresas nebus skelbiamas.